Bacterial Genome Data mining & Bioinformatic Analysis
Curriculum vitae for Dr. Xiangyang Li
Google search
Chinese Version [中文版]
       

SRA序列数据提交

 

首先注册一个NCBI账号(网址:https://www.ncbi.nlm.nih.gov/account/?back_url=http%3A%2F%2Fwww.ncbi.nlm.nih.gov%2F)

然后分三步骤:

  1. 将数据在Bioproject数据库注册(网址:https://submit.ncbi.nlm.nih.gov/subs/bioproject/),获取Bioproject ID,注意一个Biproject ID 可以对应多个Biosample;
  2. 将数据在Biosample数据库注册(网址:https://submit.ncbi.nlm.nih.gov/subs/biosample/),获取Biosample ID,注意每一个菌株对应一个Biosample ID,如果你有多个菌株测序结果,可以通过提交过程中的一个界面下载表格批量提交;
  3. 进入SRA提交页面(网址:https://submit.ncbi.nlm.nih.gov/subs/sra/),点击New submission,根据每一步提示完成提交,最后可以获得我们所需要的SRA ID。

这一步最关键的就是如何上传测序数据文件,建议通过Aspera connect软件来完成。下载安装Aspera connect,如果安装正确,在第三步提交SRA的过程中会出现上传测序数据文件的界面,选择上传文件,自动会弹出Aspera connect界面,根据提示一步一步走就可以完成上传过程。

 

 
Website maintained by Li
No.1,Shizishan Street·Hongshan District·Wuhan·Hubei Province·430070·P.R.China (located in HuaZhong Agricultural University)
The Microbial Genomic Analysis Centre *Copyright 2013 - 2014 All rights reserved. [鄂ICP ID: 13005282号]